一线城市的医疗资源相对丰富，医院的设备和技术水平也更高，故而费用通常会高于二三线城市。例如，北京、上海等一线城市的第三代试管婴儿费用可能在810万元左右，而一些二三线城市的费用则可能在57万元左右。医院的级别和口碑也会影响费用。大型三甲医院的医疗设备和专家团队更强大，相应的费用也会更高。一些私立医院或规模较小的医院，费用可能会相对低一些，但医疗水平和服务质量可能存在差异，需要谨慎选择。患者自身的情况也会影响收尾时的费用。
例如，如果患者存在卵巢功能减退、子宫内膜异位症等问题，可能需要进行额外的检查和治疗，因此增加费用。加之，如果需要进行多次促排卵或移植，费用也会相应增加。促排卵药物的费用是第三代试管婴儿过程中一项重要的支出。促排卵药物的种类繁多，价格也差异较大，具体费用取决于患者的卵巢反应性和医生的用药方案。一般情况下，促排卵药物的费用在13万元之间。手术和实验室操作费用也是构成总费用的重要部分。这包括促排卵手术、体外受精、胚胎培养、PGD/PGS检测等环节。
这些环节的费用通常较为固定，但不同医院的收费标准可能略有不同。胚胎保存和保存费用也是需要考虑的因素。如果一次移植未成功，可以将剩余的胚胎保存保存起来，以便下次移植使用。胚胎保存和保存的费用通常在每年几千元不等。